دانشگاه فردوسی مشهد، جزو اولین دانشگاه‌هایی است که در زمینه تاسیس دانشگاه مجازی اقدام نموده است. ایده ایجاد دانشگاه مجازی در سال ۱۳۸۰ در دانشگاه شکل گرفت و متعاقب آن کمیته دانشگاه مجازی با محوریت مرکز اطلاعات،‌ آمار و امور رایانه‌ای دانشگاه تشکیل شد.

هدف این کمیته، مطالعه بر روی تاسیس دانشگاه مجازی و زمینه‌های اجرایی آن بود. از اقدامات این کمیته راه‌اندازی آموزش مجازی در سطح دانشگاه بود که با کسب مجوزهای مربوطه، ۴ واحد از دروس عمومی در سال ۱۳۸۲ از این طریق ارائه شد. همچنین در سال ۱۳۸۳ نیز ۸ واحد از دروس پایه نیز بر بستر آموزش مجازی ارائه گردید. در ضمن محتوای بیش از ۱۰۰ درس نیز در پورتال آموزش مجازی دانشگاه قرار گرفته است که به‌صورت آموزش مجازی، نیمه مجازی یا کمک درسی، مورد بهره‌برداری قرار می‌گیرد.

از سال ۱۳۸۵ با هدف تمرکز امور آموزش مجازی دانشگاه و گسترش آن، مرکز مستقل «آموزش‌های الکترونیکی دانشگاه فردوسی مشهد» تاسیس شد.

با پیگیری‌های صورت گرفته و در راستای تاسیس دانشگاه مجازی فردوسی مشهد، مجوز تاسیس و راه‌اندازی ۱۰ رشته در مقطع کارشناسی‌ارشد از طرف هیات رئیسه دانشگاه صادر و پذیرش دانشجو از سال ۱۳۹۰ در این مرکز آغاز شد.

روسای کمیته دانشگاه مجازی و مرکز آموزش‌های الکترونیکی دانشگاه از زمان تاسیس آنها در جدول آمده است.